我想在楼顶打一个洞做楼梯上去,会影响到楼顶的防水层结构么?

应该先向有关部门申请审批，在不影响楼房整体承重结构的情况下，找专业建筑施工人员施工。
 
追问这个问题我已经向物业提出申请了，物业也同意我的申请，只是他还要我提交一份保证书，说以后要是楼顶出现了漏水现象（整个楼顶，不管哪一处）就得让我来承担，理由就是：楼顶的防水层是一个整体的，我打了个洞，破坏了整个楼顶的防水层。我对屋顶的防水结构设计不是那么太懂，就是觉得我就开了一个口，就能破坏到整个楼顶的防水层么？我就在犹豫这个保证书是否应该签

打掉部分能做好防水层，其他地方的防水基本上不会受到影响（如果房子最初的屋面防水不存在空鼓现象），你阳台上做楼梯，存在一定危险(结构承载是否有影响)，要看具体房子构造；还有一点你屋顶是不是斜坡，处于排水面，遇到台风暴雨，直接流进你家阳台。 从你的问题来回答是不会造成什么影响的。
 
追问那么我打这么一个洞（2.5m*1m的口）会影响到整个楼顶的防水层么（楼顶面积有约120平米）？物业已经同意我打这个口了，只是同时还要我写一份保证书，说这样会破坏整个楼顶的防水层，整个楼顶以后要是漏水了就得我来承担。

做好了就不存在影响，因你已经把你自己做的地方处理了