“两套不同年份买的房，想一起办证，一套和二套怎么区分？”

首先，我对你说明的情况，不是太明白。后期建的新房，当时的规划用途是什么，没说明白。如果要按获拆迁补偿多少的话，当然是新房子。老房子的话也能获得拆迁补偿，只是相对较少，因为现在国家很关注民生问题，特别是稳定问题，不可能不给的。（农村很多都是分家后，自己建房出来住，产生这种问题很正常，不用太着急）农村自建房是由当地村委会审核，然后上报当地上级镇、乡政府的。一般不会影响拆迁补偿。要想获得较多拆迁补偿，那就赶紧把房子周围都种上经济作物吧。（呵呵）