水垢的主要成分是钙镁离子与酸根离子（大多数是碳酸根CO3 2-）形成的难溶盐，加入食醋就是加入了乙酸（CH3COOH，简写为HAc），也就是加入了水合氢离子（H3O+），水合氢离子有极强的氧化性，可以将难溶盐中的金属部分转化为阳离子，然后自身和碳酸根离子结合形成碳酸氢根离子和碳酸。碳酸是弱酸，而且用食醋除水垢时候要加热，所以碳酸变成水和二氧化碳放掉了。碳酸氢钙和碳酸氢镁溶于水，所以水垢消失了。
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